インストール後に生成されるシンボリックリンクがパッケージの中に移動したため、ca-certificates-utils 20170307-1 のアップグレードは手動で行う必要があります。
シンボリックリンクを削除するとパッケージのダウンロードができなくなる可能性があります。以下のコマンドでアップグレードを行うようにしてください:
# pacman -Syuw # download packages
# rm /etc/ssl/certs/ca-certificates.crt # remove conflicting file
# pacman -Su # perform upgrade